关键字：RNA病毒测序, 病毒全基因组测序, RNA噬菌体全基因组测序

RNA病毒全基因组测序——案例1

样品：发病动物肠道

目标：冠状病毒全基因组测序

项目简述：按样本准备指南提取核酸，核酸送至探普进行质量检查后启动建库测序，测序完成后生物信息学处理和拼接。

样本准备指南：探普生物公众号-病毒测序-样本处理

冠状病毒基因组是最大的RNA病毒基因组。冠状病毒全基因组测序项目是目前探普接到最多的RNA病毒测序项目，迄今已经完成多种型别的冠状病毒的基因组测序，组装结果大部分达到99%以上。

RNA病毒全基因组测序——案例2

样品：禽组织的星状病毒

目标：星状病毒全基因组测序

项目简述：按样本准备指南提取核酸（超速离心纯化），核酸送至探普进行质量检查后启动建库测序，测序完成后生物信息学处理和拼接。

星状病毒基因组不大，只有7kb左右。按照要求提取的星状病毒RNA都可获得99%以上的全序列。

RNA噬菌体全基因组测序——案例3

样品：噬菌斑纯化的RNA噬菌体

目标：RNA噬菌体全基因组测序

项目简述：按样本准备指南提取核酸（超速离心纯化并核酸酶处理），核酸送至探普进行质量检查后启动建库测序，测序完成后生物信息学处理和拼接注释。

噬菌体全基因组测序项目一般来自环境分离的噬菌体样品，往往比对不到已知的基因组。而且基因组大小跨度非常大。所以，噬菌体一定要富集纯化且保证完整性。噬菌体测序目的不仅仅是基因组序列，一般还需要基因注释和功能预测。